1．進豬后如發現豬跑動有墊料粉塵泛起，證明墊料干燥，要用噴淋水做濕度調整，加水量為豬跑動墊料不泛起粉塵墊料為止。
2．正常運行的墊料，其中心部應是無氨味，濕度在50％-60％，手握小成團，較松。溫度在45℃左右；表層濕度在45％左后，溫度與環境溫度接近，一般為15～20℃，pH值7～8，否則不正常。
3．注意排濕墊料過濕，即表層超過45％，中心部墊料超過60％就會影響發酵效果，可采用自然通風或者強制通風的方法對圈舍墊料加以減濕，或添加較干的有機墊料調濕。
4．如糞便比較集中時，要把比較集中的糞便分散開，或翻入表層墊料20～30厘米處，提高糞便降解速度。
5．用藥注意。原生態墊料上不得使用化學藥品和抗生素類藥物，因其對功能微生物具有殺傷作用，會使微生物活性降低，不利于菌種正�；顒�。墊料外和舍外可用消毒劑消毒，以抑制墊料外部環境中有害菌的生長、繁殖。
6．豬出欄后將終料重新堆積發酵十分重要，主要是利用發酵產生的生物熱殺滅墊料中的雜菌，其作用相當于傳統工藝的轉群空欄后的沖洗消毒。（1）生豬全部出欄后，用小型挖掘機或鏟車（也可用人工）將墊料從底部徹底翻均一遍。在堆積發酵前根據具體情況。可以適當補充新墊料和HM墊料發酵基，重新混合堆積發酵。2)將表層確定不能用的墊料清出，制成有機肥，重新按原料比例發酵新墊料部方法同墊料發酵操作相同，發酵結束后，攤開墊料，鋪好發酵床，聞隔24小時，確認表面不起粉塵，墊料溫度平穩后即可進豬飼養。
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